Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NfyaP23708 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfyaP23708 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NfyaP23708 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfyaP23708 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfyaP23708 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfyaP23708 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfyaP23708 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfyaP23708 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms