Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NefhP19246 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NefhP19246 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefhP19246 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefhP19246 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefhP19246 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefhP19246 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefhP19246 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefhP19246 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NefhP19246 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefhP19246 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefhP19246 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefhP19246 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefhP19246 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NefhP19246 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefhP19246 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NefhP19246 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefhP19246 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NefhP19246 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefhP19246 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefhP19246 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefhP19246 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefhP19246 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefhP19246 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefhP19246 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NefhP19246 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefhP19246 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefhP19246 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefhP19246 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NefhP19246 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefhP19246 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefhP19246 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefhP19246 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefhP19246 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefhP19246 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefhP19246 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefhP19246 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefhP19246 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NefhP19246 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NefhP19246 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NefhP19246 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NefhP19246 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefhP19246 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefhP19246 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefhP19246 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefhP19246 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefhP19246 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefhP19246 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefhP19246 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefhP19246 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefhP19246 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NefhP19246 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefhP19246 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefhP19246 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefhP19246 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefhP19246 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefhP19246 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NefhP19246 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefhP19246 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefhP19246 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NefhP19246 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefhP19246 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefhP19246 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefhP19246 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NefhP19246 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefhP19246 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefhP19246 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefhP19246 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NefhP19246 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NefhP19246 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NefhP19246 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NefhP19246 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefhP19246 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefhP19246 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefhP19246 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefhP19246 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefhP19246 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefhP19246 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefhP19246 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefhP19246 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefhP19246 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NefhP19246 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefhP19246 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefhP19246 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefhP19246 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefhP19246 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefhP19246 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NefhP19246 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefhP19246 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefhP19246 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefhP19246 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefhP19246 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefhP19246 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefhP19246 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NefhP19246 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NefhP19246 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefhP19246 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NefhP19246 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefhP19246 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefhP19246 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms