Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csn1s1P19228 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms