Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd1P19182 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifrd1P19182 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifrd1P19182 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifrd1P19182 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifrd1P19182 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifrd1P19182 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifrd1P19182 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms