Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lama1P19137 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lama1P19137 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lama1P19137 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lama1P19137 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lama1P19137 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lama1P19137 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lama1P19137 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lama1P19137 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lama1P19137 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lama1P19137 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lama1P19137 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 447.2 ms