Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnc1P19123 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnc1P19123 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms