Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkceP16054 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkceP16054 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkceP16054 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkceP16054 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkceP16054 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkceP16054 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkceP16054 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkceP16054 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkceP16054 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkceP16054 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms