Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cntn1P12960 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntn1P12960 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms