Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col1a1P11087 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col1a1P11087 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col1a1P11087 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms