Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP10400 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP10400 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP10400 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP10400 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP10400 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP10400 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP10400 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP10400 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP10400 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP10400 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP10400 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP10400 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP10400 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP10400 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP10400 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP10400 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP10400 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP10400 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP10400 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP10400 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP10400 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP10400 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP10400 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP10400 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP10400 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP10400 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP10400 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP10400 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP10400 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP10400 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP10400 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP10400 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP10400 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PolP10400 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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