Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxc9P09633 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxc9P09633 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc9P09633 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms