Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd3P09027 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms