Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc8P09025 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc8P09025 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc8P09025 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms