Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06329 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06329 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06329 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06329 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06329 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06329 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06329 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06329 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06329 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06329 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06329 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06329 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06329 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06329 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06329 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06329 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06329 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06329 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06329 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06329 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06329 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06329 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06329 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06329 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P06329 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06329 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06329 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06329 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06329 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06329 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06329 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06329 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06329 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06329 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06329 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06329 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06329 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06329 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06329 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06329 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06329 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06329 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06329 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06329 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06329 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06329 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06329 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06329 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06329 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06329 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06329 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06329 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06329 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06329 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06329 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06329 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06329 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06329 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06329 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P06329 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms