Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd3dP04235 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd3dP04235 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd3dP04235 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms