Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01823 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01823 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01823 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01823 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01823 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01823 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01823 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01823 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01823 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01823 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01823 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01823 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01823 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01823 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01823 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01823 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01823 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01823 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01823 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01823 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01823 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01823 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01823 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01823 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01823 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01823 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01823 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01823 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01823 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01823 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
P01823 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01823 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01823 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01823 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01823 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01823 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01823 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01823 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01823 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01823 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01823 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01823 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01823 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01823 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01823 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01823 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01823 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01823 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01823 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01823 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01823 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01823 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01823 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01823 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01823 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01823 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01823 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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