Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01741 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01741 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01741 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01741 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01741 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01741 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01741 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01741 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01741 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01741 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01741 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01741 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01741 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01741 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01741 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01741 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01741 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01741 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01741 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01741 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01741 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01741 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01741 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01741 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01741 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01741 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01741 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01741 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01741 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01741 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms