Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01650 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01650 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01650 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01650 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01650 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01650 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01650 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01650 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01650 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
P01650 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01650 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01650 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01650 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01650 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01650 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01650 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01650 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01650 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01650 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01650 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01650 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01650 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01650 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01650 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01650 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01650 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01650 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01650 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01650 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01650 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P01650 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01650 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01650 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01650 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01650 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01650 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P01650 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P01650 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P01650 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01650 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01650 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01650 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P01650 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01650 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01650 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01650 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01650 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01650 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01650 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01650 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01650 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01650 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01650 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01650 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01650 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01650 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01650 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01650 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01650 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01650 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01650 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01650 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01650 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01650 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P01650 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01650 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01650 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01650 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01650 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01650 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01650 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01650 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01650 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01650 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01650 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01650 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01650 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01650 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01650 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01650 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01650 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01650 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01650 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01650 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01650 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01650 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01650 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01650 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01650 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01650 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
P01650 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01650 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
P01650 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01650 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01650 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01650 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01650 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01650 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01650 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms