Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01649 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01649 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01649 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01649 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01649 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01649 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01649 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01649 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01649 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01649 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01649 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01649 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01649 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01649 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01649 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01649 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01649 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01649 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01649 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01649 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01649 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01649 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01649 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01649 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01649 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01649 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01649 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01649 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01649 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01649 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01649 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01649 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01649 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01649 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01649 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01649 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01649 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01649 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01649 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01649 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01649 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01649 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01649 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01649 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01649 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01649 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01649 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01649 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01649 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01649 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01649 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01649 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01649 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01649 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01649 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01649 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01649 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01649 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01649 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01649 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01649 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01649 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01649 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01649 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01649 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01649 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01649 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01649 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01649 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01649 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01649 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01649 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01649 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01649 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01649 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01649 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01649 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01649 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01649 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01649 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01649 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01649 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01649 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01649 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01649 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01649 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01649 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01649 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms