Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01648 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01648 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01648 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01648 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01648 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01648 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01648 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01648 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01648 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01648 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01648 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01648 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P01648 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01648 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01648 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01648 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01648 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01648 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
P01648 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01648 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01648 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01648 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01648 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01648 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P01648 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P01648 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01648 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01648 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01648 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01648 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01648 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P01648 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01648 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01648 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01648 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01648 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
P01648 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01648 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01648 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01648 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01648 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01648 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01648 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01648 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01648 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01648 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
P01648 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01648 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01648 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01648 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01648 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
P01648 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01648 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01648 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01648 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01648 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01648 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01648 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01648 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01648 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01648 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01648 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01648 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01648 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01648 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01648 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01648 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01648 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01648 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01648 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01648 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01648 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01648 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01648 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01648 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01648 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01648 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01648 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01648 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01648 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01648 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01648 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01648 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
P01648 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01648 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01648 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
P01648 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01648 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01648 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01648 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01648 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01648 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01648 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01648 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01648 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01648 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01648 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P01648 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01648 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms