Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vti1aO89116 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vti1aO89116 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms