Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx8O88983 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx8O88983 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx8O88983 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx8O88983 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx8O88983 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx8O88983 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx8O88983 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx8O88983 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx8O88983 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx8O88983 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx8O88983 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms