Protein–RNA interactions for Protein: O88741

Gdap1, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdap1O88741 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdap1O88741 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gdap1O88741 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdap1O88741 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms