Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn2O88552 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn2O88552 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms