Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdh7O88451 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdh7O88451 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdh7O88451 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh7O88451 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rdh7O88451 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms