Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AvilO88398 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AvilO88398 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AvilO88398 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AvilO88398 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AvilO88398 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AvilO88398 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AvilO88398 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AvilO88398 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AvilO88398 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AvilO88398 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AvilO88398 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AvilO88398 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AvilO88398 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AvilO88398 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AvilO88398 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AvilO88398 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AvilO88398 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AvilO88398 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AvilO88398 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AvilO88398 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AvilO88398 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AvilO88398 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AvilO88398 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AvilO88398 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AvilO88398 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AvilO88398 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AvilO88398 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AvilO88398 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AvilO88398 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AvilO88398 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AvilO88398 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AvilO88398 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AvilO88398 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AvilO88398 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AvilO88398 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AvilO88398 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AvilO88398 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AvilO88398 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AvilO88398 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AvilO88398 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AvilO88398 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AvilO88398 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AvilO88398 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AvilO88398 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AvilO88398 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AvilO88398 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AvilO88398 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AvilO88398 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AvilO88398 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AvilO88398 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AvilO88398 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AvilO88398 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AvilO88398 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AvilO88398 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AvilO88398 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AvilO88398 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AvilO88398 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AvilO88398 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AvilO88398 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AvilO88398 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AvilO88398 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AvilO88398 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AvilO88398 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AvilO88398 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AvilO88398 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AvilO88398 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AvilO88398 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AvilO88398 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AvilO88398 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AvilO88398 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AvilO88398 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AvilO88398 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AvilO88398 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AvilO88398 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AvilO88398 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AvilO88398 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AvilO88398 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AvilO88398 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AvilO88398 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AvilO88398 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AvilO88398 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AvilO88398 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AvilO88398 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AvilO88398 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AvilO88398 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AvilO88398 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AvilO88398 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AvilO88398 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AvilO88398 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AvilO88398 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AvilO88398 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AvilO88398 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AvilO88398 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AvilO88398 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AvilO88398 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AvilO88398 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AvilO88398 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AvilO88398 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AvilO88398 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms