Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntsr1O88319 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ntsr1O88319 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntsr1O88319 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms