Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hmx1O70218 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmx1O70218 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmx1O70218 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmx1O70218 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms