Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp2a2O55143 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp2a2O55143 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms