Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Sema6bO54951 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sema6bO54951 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sema6bO54951 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sema6bO54951 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sema6bO54951 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sema6bO54951 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Sema6bO54951 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sema6bO54951 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sema6bO54951 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sema6bO54951 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sema6bO54951 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms