Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb3O54890 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms