Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EdaO54693 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EdaO54693 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EdaO54693 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EdaO54693 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EdaO54693 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EdaO54693 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EdaO54693 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EdaO54693 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EdaO54693 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EdaO54693 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EdaO54693 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EdaO54693 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EdaO54693 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EdaO54693 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EdaO54693 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EdaO54693 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EdaO54693 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EdaO54693 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EdaO54693 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EdaO54693 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EdaO54693 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EdaO54693 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EdaO54693 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EdaO54693 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EdaO54693 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EdaO54693 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EdaO54693 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EdaO54693 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EdaO54693 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EdaO54693 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EdaO54693 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EdaO54693 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EdaO54693 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EdaO54693 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EdaO54693 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EdaO54693 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EdaO54693 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EdaO54693 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EdaO54693 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EdaO54693 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EdaO54693 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EdaO54693 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EdaO54693 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EdaO54693 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EdaO54693 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EdaO54693 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EdaO54693 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EdaO54693 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EdaO54693 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EdaO54693 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EdaO54693 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EdaO54693 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EdaO54693 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EdaO54693 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EdaO54693 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EdaO54693 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EdaO54693 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EdaO54693 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EdaO54693 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EdaO54693 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EdaO54693 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EdaO54693 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EdaO54693 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EdaO54693 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EdaO54693 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EdaO54693 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EdaO54693 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EdaO54693 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EdaO54693 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EdaO54693 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EdaO54693 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EdaO54693 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EdaO54693 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EdaO54693 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EdaO54693 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EdaO54693 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
EdaO54693 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EdaO54693 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EdaO54693 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EdaO54693 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EdaO54693 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EdaO54693 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EdaO54693 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EdaO54693 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EdaO54693 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EdaO54693 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EdaO54693 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EdaO54693 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EdaO54693 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EdaO54693 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EdaO54693 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EdaO54693 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EdaO54693 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EdaO54693 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EdaO54693 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EdaO54693 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EdaO54693 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EdaO54693 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EdaO54693 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms