Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FxnO35943 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FxnO35943 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FxnO35943 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FxnO35943 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FxnO35943 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FxnO35943 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FxnO35943 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FxnO35943 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FxnO35943 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FxnO35943 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FxnO35943 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FxnO35943 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FxnO35943 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FxnO35943 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FxnO35943 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FxnO35943 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FxnO35943 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FxnO35943 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FxnO35943 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FxnO35943 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FxnO35943 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FxnO35943 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FxnO35943 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FxnO35943 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FxnO35943 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FxnO35943 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FxnO35943 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FxnO35943 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FxnO35943 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FxnO35943 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FxnO35943 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FxnO35943 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FxnO35943 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FxnO35943 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FxnO35943 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FxnO35943 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FxnO35943 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FxnO35943 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FxnO35943 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FxnO35943 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FxnO35943 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FxnO35943 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FxnO35943 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FxnO35943 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FxnO35943 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FxnO35943 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FxnO35943 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FxnO35943 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FxnO35943 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FxnO35943 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FxnO35943 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FxnO35943 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FxnO35943 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FxnO35943 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FxnO35943 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FxnO35943 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FxnO35943 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
FxnO35943 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FxnO35943 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FxnO35943 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FxnO35943 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FxnO35943 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FxnO35943 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FxnO35943 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FxnO35943 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FxnO35943 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FxnO35943 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FxnO35943 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FxnO35943 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FxnO35943 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FxnO35943 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FxnO35943 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FxnO35943 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FxnO35943 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FxnO35943 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FxnO35943 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FxnO35943 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FxnO35943 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FxnO35943 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FxnO35943 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FxnO35943 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FxnO35943 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FxnO35943 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FxnO35943 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FxnO35943 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FxnO35943 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FxnO35943 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FxnO35943 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FxnO35943 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FxnO35943 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FxnO35943 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FxnO35943 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FxnO35943 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FxnO35943 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FxnO35943 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FxnO35943 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FxnO35943 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FxnO35943 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FxnO35943 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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