Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpibO35906 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpibO35906 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpibO35906 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SpibO35906 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SpibO35906 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SpibO35906 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SpibO35906 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SpibO35906 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SpibO35906 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SpibO35906 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpibO35906 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpibO35906 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpibO35906 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpibO35906 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpibO35906 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpibO35906 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpibO35906 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SpibO35906 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SpibO35906 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SpibO35906 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpibO35906 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpibO35906 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpibO35906 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpibO35906 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpibO35906 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpibO35906 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpibO35906 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpibO35906 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SpibO35906 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SpibO35906 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SpibO35906 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SpibO35906 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SpibO35906 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SpibO35906 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SpibO35906 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SpibO35906 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SpibO35906 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SpibO35906 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SpibO35906 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SpibO35906 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SpibO35906 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SpibO35906 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SpibO35906 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpibO35906 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpibO35906 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpibO35906 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpibO35906 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpibO35906 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpibO35906 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpibO35906 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpibO35906 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SpibO35906 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SpibO35906 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SpibO35906 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SpibO35906 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SpibO35906 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SpibO35906 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SpibO35906 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SpibO35906 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SpibO35906 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SpibO35906 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SpibO35906 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SpibO35906 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SpibO35906 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SpibO35906 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SpibO35906 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SpibO35906 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SpibO35906 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SpibO35906 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SpibO35906 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SpibO35906 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpibO35906 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpibO35906 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpibO35906 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpibO35906 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SpibO35906 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpibO35906 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpibO35906 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpibO35906 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpibO35906 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpibO35906 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpibO35906 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpibO35906 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpibO35906 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpibO35906 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpibO35906 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpibO35906 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpibO35906 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpibO35906 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpibO35906 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SpibO35906 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SpibO35906 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SpibO35906 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SpibO35906 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SpibO35906 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SpibO35906 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SpibO35906 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SpibO35906 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SpibO35906 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.6 ms