Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sp100O35892 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp100O35892 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp100O35892 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp100O35892 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp100O35892 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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Sp100O35892 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp100O35892 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp100O35892 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp100O35892 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp100O35892 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp100O35892 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp100O35892 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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