Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops5O35864 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops5O35864 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops5O35864 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cops5O35864 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cops5O35864 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops5O35864 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops5O35864 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops5O35864 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops5O35864 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops5O35864 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops5O35864 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops5O35864 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops5O35864 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops5O35864 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops5O35864 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms