Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf9O35739 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf9O35739 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf9O35739 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klf9O35739 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf9O35739 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf9O35739 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf9O35739 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms