Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NudcO35685 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NudcO35685 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NudcO35685 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NudcO35685 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NudcO35685 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NudcO35685 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NudcO35685 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NudcO35685 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NudcO35685 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NudcO35685 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NudcO35685 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NudcO35685 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NudcO35685 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NudcO35685 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NudcO35685 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NudcO35685 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NudcO35685 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NudcO35685 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NudcO35685 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NudcO35685 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NudcO35685 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NudcO35685 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NudcO35685 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NudcO35685 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NudcO35685 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NudcO35685 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NudcO35685 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NudcO35685 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NudcO35685 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NudcO35685 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NudcO35685 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NudcO35685 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NudcO35685 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NudcO35685 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NudcO35685 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NudcO35685 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NudcO35685 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NudcO35685 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NudcO35685 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NudcO35685 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NudcO35685 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NudcO35685 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NudcO35685 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NudcO35685 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NudcO35685 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NudcO35685 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NudcO35685 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NudcO35685 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NudcO35685 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NudcO35685 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NudcO35685 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NudcO35685 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NudcO35685 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NudcO35685 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NudcO35685 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NudcO35685 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NudcO35685 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NudcO35685 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NudcO35685 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NudcO35685 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NudcO35685 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NudcO35685 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NudcO35685 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NudcO35685 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NudcO35685 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NudcO35685 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NudcO35685 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NudcO35685 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NudcO35685 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NudcO35685 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NudcO35685 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NudcO35685 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NudcO35685 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NudcO35685 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NudcO35685 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NudcO35685 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NudcO35685 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NudcO35685 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NudcO35685 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NudcO35685 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NudcO35685 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NudcO35685 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NudcO35685 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NudcO35685 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NudcO35685 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NudcO35685 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NudcO35685 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NudcO35685 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NudcO35685 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NudcO35685 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NudcO35685 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NudcO35685 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NudcO35685 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
NudcO35685 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NudcO35685 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NudcO35685 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NudcO35685 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NudcO35685 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NudcO35685 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms