Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnih1O35372 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnih1O35372 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih1O35372 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih1O35372 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih1O35372 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih1O35372 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih1O35372 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih1O35372 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih1O35372 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih1O35372 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih1O35372 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih1O35372 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms