Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn4O35054 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn4O35054 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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