Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp2O08574 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp2O08574 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp2O08574 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp2O08574 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp2O08574 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp2O08574 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp2O08574 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp2O08574 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp2O08574 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp2O08574 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp2O08574 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp2O08574 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp2O08574 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms