Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21310J3QQ23 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21310J3QQ23 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms