Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm20795J3QP49 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm20795J3QP49 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm20795J3QP49 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm20795J3QP49 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gm20795J3QP49 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm20795J3QP49 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm20795J3QP49 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20795J3QP49 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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