Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21972J3QN38 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.7 ms