Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm21969J3QJZ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm21969J3QJZ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm21969J3QJZ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm21969J3QJZ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm21969J3QJZ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm21969J3QJZ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm21969J3QJZ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm21969J3QJZ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm21969J3QJZ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm21969J3QJZ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21969J3QJZ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm21969J3QJZ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm21969J3QJZ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm21969J3QJZ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm21969J3QJZ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms