Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21060J3KMU4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms