Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XntrpcF8VQM8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XntrpcF8VQM8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms