Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Srp72F8VQC1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Srp72F8VQC1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms