Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4aF8VPX6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4aF8VPX6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4aF8VPX6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms