Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5160F8VPN3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5160F8VPN3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms